66-280 Basics of macromolecular crystallography

Lehrende: Prof. Dr. Arwen Ruth Pearson; Dr. Eike-Christian Schulz; Dr. Andrea Thorn

Veranstaltungsart: Vorlesung

Anzeige im Stundenplan: Crystallography

Semesterwochenstunden: 2

Unterrichtssprache: Englisch

Min. | Max. Teilnehmerzahl: 6 | -

Weitere Informationen:
Empfohlene Voraussetzungen: Grundlagen der Biochemie, insbesondere der Proteinchemie, z.B. aus CHE 021 A; PHY-N3 bietet eine zusätzliche Perspektive zu diesem Modul

Kommentare/ Inhalte:
(1) Kristallisation von biologischen Makromolekülen: Gängige Methoden, Phasendiagramm, Troubleshooting, Cryo Protection, Co-kristallisation und Soaking-Experimente
(2) Datensammlung, Funktionsweise von Röntgenquellen, Detektoren
(3) Diffraktionsgeometrie
(4) Zeitaufgelöste Kristallographie, FEL
(5) Symmetrie, Ebenen- und Raumgruppen
(6) Integration und Skalierung von Diffraktionsdaten
(7) Das Phasenproblem, Molekularer Ersatz, experimentelle Phasierung
(8) Verfeinerung von Molekülstruktur-Modellen, Cross-Validierung, Parameter und Datenqualität, Auflösung
(9) Datenbanken und Strukturvalidierung anhand von Geometrie, Datenqualität und wichtigen Kennzahlen
(10) Komplementäre Rechenmethoden: Strukturvorhersage & künstliche Intelligenz
(11) Geschichte der Kristallographie

Lernziel:
Die Studierenden erlernen ein Grundwissen in der Kristallographie, und alle theoretischen Grundlagen für eine eigene einfache Strukturlösung. Sie verstehen Sie sind in der Lage, Fachpublikationen zu verstehen und kritisch zu bewerten und veröffentlichte Strukturen in den gängigen Datenbanken zu suchen und die experimentelle Bestimmung zu bewerten.

Literatur:
Biomolecular Crystallography: Principles, Practice, and Application to Structural Biology, Bernhard Rupp, Garland Science 2009, ISBN 9781134064199