67-102 Vorlesung Angewandte Bioinformatik: Sequenzen

Lehrende: Prof. Dr. Andrew Ernest Torda; Timur Olzhabaev

Veranstaltungsart: Vorlesung

Anzeige im Stundenplan: VL-ASE

Semesterwochenstunden: 2

Credits: 3,0

Unterrichtssprache: Deutsch

Min. | Max. Teilnehmerzahl: - | 60

Kommentare/ Inhalte:
In den letzten Jahren haben sich die verfügbaren Informationen zu biologischen Sequenzen vervielfacht.
In diesem Modul werden aus anwendungsorientierter Sicht die wichtigsten Methoden, Softwareanwendungen und Web-Ressourcen vorgestellt,
um diese Informationen sinnvoll zu nutzen. Es werden insbesondere die folgenden Themen besprochen:

• Grundlagen der Analyse biologischer Sequenzen,
  
• Techniken zur Sequenzierung von DNA und Proteinen,
  
• Strategien für die Assemblierung und Annotation von Genomen,
  
• Sequenzvergleiche und Ähnlichkeitssuche in biologischen Sequenzen,
  
• Rekonstruktion phylogenetischer Stammbäume.
  

Lernziel:
Die Studierenden haben grundlegende Kenntnisse der Angewandten Bioinformatik in den Bereichen Sequenz- und Genomanalyse. Sie kennen die gebräuchlichen Datenformate in der Sequenzanalyse und können sicher mit biologischen Datenbanken und Web-Anwendungen umgehen. Die Studierenden haben grundlegende Kenntnisse der phylogenetischen Analyse auf der Basis multipler Sequenzvergleiche. Sie verfügen über Erfahrung im Umgang mit Daten aus neuen Sequenzierungstechnologien.

Vorgehen:
Vorlesung mit Folienpräsentation